Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms