Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPR78Q96P69 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms