Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGD4Q96M96 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms