Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP6Q96FZ7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms