Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ECHDC3Q96DC8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ECHDC3Q96DC8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms