Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms