Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms