Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SEMA6DQ8NFY4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SEMA6DQ8NFY4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA6DQ8NFY4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SEMA6DQ8NFY4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SEMA6DQ8NFY4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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