Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS8Q8N3P4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS8Q8N3P4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms