Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLIP4Q8N3C7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP4Q8N3C7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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