Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM48Q8IWZ4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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