Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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