Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EEF1DP3Q658K8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEF1DP3Q658K8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms