Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms