Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C3orf38Q5JPI3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms