Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETM2Q2VYF4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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