Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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