Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NTRK3Q16288 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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