Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms