Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms