Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEMA3AQ14563 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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