Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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