Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms