Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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