Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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