Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP140Q13342 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP140Q13342 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP140Q13342 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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