Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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