Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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