Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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