Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms