Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms