Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CD164Q04900 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CD164Q04900 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms