Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF3P78545 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF3P78545 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF3P78545 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF3P78545 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF3P78545 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF3P78545 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF3P78545 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms