Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms