Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NME5P56597 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NME5P56597 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME5P56597 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms