Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTCL1P53675 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCL1P53675 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms