Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms