Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP5P51878 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP5P51878 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms