Protein–RNA interactions for Protein: P51798

CLCN7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN7P51798 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLCN7P51798 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCN7P51798 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms