Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms