Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms