Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms