Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD27P26842 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms