Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PLNP26678 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PLNP26678 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PLNP26678 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms