Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO2P25791 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO2P25791 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms