Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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