Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF1P22415 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF1P22415 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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