Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT4P19013 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT4P19013 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT4P19013 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT4P19013 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms