Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PEPDP12955 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PEPDP12955 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PEPDP12955 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PEPDP12955 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PEPDP12955 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms