Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms